1923
พิพิธภัณฑ์พยาธิวิทยาเอลลิส คณะแพทยศาสตร์ศิริราชพยาบาล
1948
พิพิธภัณฑ์กายวิภาคศาสตร์คองดอน คณะแพทยศาสตร์ศิริราชพยาบาล
1963
ห้องมหิดลอดุลเดช หอสมุดศิริราช (เดิมชื่อ “ห้องสมเด็จพระราชบิดา”)
1965
พิพิธภัณฑ์นิติวิทยาศาสตร์ สงกรานต์ นิยมเสน คณะแพทยศาสตร์ศิริราชพยาบาล
1970
พิพิธภัณฑ์ปรสิตวิทยา คณะแพทยศาสตร์ศิริราชพยาบาล
1972
พิพิธภัณฑ์ก่อนประวัติศาสตร์และห้องปฏิบัติการ สุด แสงวิเชียร คณะแพทยศาสตร์ศิริราชพยาบาล
1979
พิพิธภัณฑ์ประวัติการแพทย์ไทย อวย เกตุสิงห์ คณะแพทยศาสตร์ศิริราชพยาบาล
1979
พิพิธภัณฑ์หอย คณะเวชศาสตร์เขตร้อน
1983
ห้องนิทรรศการประวัติและผลงานของสถาบันพัฒนาสุขภาพอาเซียน
1984
พิพิธภัณฑ์ยุงและคลังตัวอย่างแมลงและสัตว์ขาข้อ คณะเวชศาสตร์เขตร้อน
1992
ฝ่ายจดหมายเหตุมหาวิทยาลัย สำนักหอสมุด มหาวิทยาลัยมหิดล
1994
ห้องสมเด็จพระบรมราชชนก คณะแพทยศาสตร์ศิริราชพยาบาล
1996
พิพิธภัณฑ์ประวัติการพยาบาลไทย คณะพยาบาลศาสตร์
1998
หอจดหมายเหตุศิริราช คณะแพทยศาสตร์ศิริราชพยาบาล มหาวิทยาลัยมหิดล
2001
เรือนไทยและพิพิธภัณฑ์มานุษยวิทยาวัฒนธรรม สถาบันวิจัยภาษาและวัฒนธรรมเอเชีย
2004
พิพิธภัณฑ์สตางค์ มงคลสุข คณะวิทยาศาสตร์
2004
พิพิธภัณฑ์เครื่องมือวิทยาศาสตร์ คณะวิทยาศาสตร์
2004
พิพิธภัณฑ์คนหูหนวกไทย
2005
หอเกียรติยศนักวิทยาศาสตร์ดีเด่น คณะวิทยาศาสตร์
2006
หอเกียรติยศอาจารย์ดีเด่น คณะวิทยาศาสตร์
2007
พิพิธภัณฑ์กลางแจ้ง เส้นทางศึกษาชีวะ-ธรณี คณะวิทยาศาสตร์
2008
พิพิธภัณฑ์พืชแห่งภูมิภาคตะวันตก มหาวิทยาลัยมหิดล วิทยาเขตกาญจนบุรี
2009
พฤกษาดุริยางค์ วิทยาลัยดุริยางคศิลป์
2010
ฝ่ายจดหมายเหตุและพิพิธภัณฑ์ หอสมุดและคลังความรู้มหาวิทยาลัยมหิดล
2010
หอจดหมายเหตุและพิพิธภัณฑ์รามาธิบดี คณะแพทยศาสตร์โรงพยาบาลรามาธิบดี
2010
พิพิธภัณฑ์คณะสาธารณสุขศาสตร์
2011
หอพระราชประวัติสมเด็จพระบรมราชชนก
2011
หอเกียรติยศแห่งมหาวิทยาลัยมหิดล
2011
ห้องนิทรรศการ และห้องจดหมายเหตุแผนที่และผังแม่บท
2011
พิพิธสาระประชากรและสังคม สถาบันวิจัยประชากรและสังคม
2013
หอพระราชประวัติศรีสวรินทิราราชภักดี และหอพระราชประวัติบรมราชบุพการีกิตติประกาศ
2013
พิพิธภัณฑ์ศิริราชพิมุขสถานคณะแพทยศาสตร์ศิริราชพยาบาล
2013
พิพิธภัณฑ์ทางสัตวแพทย์
2015
พิพิธภัณฑ์สัมผัส เฉลิมพระเกียรติสมเด็จพระบรมราชินีนาถคณะแพทยศาสตร์ศิริราชพยาบาล
2015
สิรินธรทันตพิพิธ คณะทันตแพทยศาสตร์
2016
พิพิธภัณฑ์การเรียนรู้โรคเขตร้อนคณะเวชศาสตร์เขตร้อน
2016
พิพิธภัณฑ์พยาบาลโรงเรียนพยาบาลรามาธิบดี
2017
พิพิธภัณฑ์การพยาบาลไทย คณะพยาบาลศาสตร์ มหาวิทยาลัยมหิดล
2017
อุทยานธรรมชาติวิทยาสิรีรุกขชาติ
2018
พิพิธภัณฑ์ธรณีศาสตร์ มหาวิทยาลัยมหิดล วิทยาเขตกาญจนบุรี
2018
อุทยานธรณีและพิพิธภัณฑ์ มหาวิทยาลัยมหิดล วิทยาเขตกาญจนบุรี
2018
หอจดหมายเหตุคณะศิลปศาสตร์
2020
พิพิธภัณฑ์ดนตรีอุษาคเนย์ วิทยาลัยดุริยางคศิลป์
