1. คณะเทคนิคการแพทย์

2. คณะวิศวกรรมศาสตร์

3. คณะสัตวแพทยศาสตร์

4. คณะสังคมศาสตร์และมนุษยศาสตร์

5. คณะสิ่งแวดล้อมและทรัพยากรศาสตร์

6. คณะเทคโนโลยีสารสนเทศและการสื่อสาร

7. คณะศิลปศาสตร์

8. คณะกายภาพบำบัด

9. สถาบันวิจัยประชากรและสังคม

10. สถาบันโภชนาการ

11. สถาบันแห่งชาติเพื่อการพัฒนาเด็กและครอบครัว

12. สถาบันวิจัยภาษาและวัฒนธรรมเอเชีย

13. สถาบันพัฒนาสุขภาพอาเซียน

14. สถาบันชีววิทยาศาสตร์โมเลกุล

15. สถาบันนวัตกรรมการเรียนรู้

16. สถาบันบริหารจัดการเทคโนโลยีและนวัตกรรม

17. สำนักงานอธิการบดี

18. สำนักงานสภามหาวิทยาลัย

19. วิทยาลัยวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีการกีฬา

20. วิทยาลัยดุริยางคศิลป์

21. วิทยาลัยนานาชาติ

22. วิทยาลัยราชสุดา

23. บัณฑิตวิทยาลัย

24. หอสมุดและคลังความรู้มหาวิทยาลัยมหิดล

25. ศูนย์สัตว์ทดลองแห่งชาติ

26. วิทยาลัยศาสนศึกษา