นอกจากเสื้อครุยวิทยฐานะแล้ว ยังมีเครื่องแต่งกายประกอบที่น่าสนใจ โดยชุดด้านในที่สวมเสื้อครุยทับด้านนอกนั้น สำหรับบัณฑิตชายสวมชุดนักศึกษาโดยสวมสูทสากลสีขาว และสำหรับบัณฑิตหญิงนั้นสวมเป็นชุดราตรียาวสีขาว เนื่องจากหลังเสร็จสิ้นพิธีประสาทปริญญาแล้ว จะมีงานเลี้ยงฉลองบัณฑิตเป็นงานเต้นรำอย่างสากลอีกด้วย

ในครั้งแรกของพิธีประสาทปริญญาให้กับบัณฑิตมหาวิทยาลัยแพทยศาสตร์เมื่อวันที่ 27 มิถุนายน พ.ศ. 2486 นั้น พันเอก ช่วง เชวงศักดิ์สงคราม รัฐมนตรีว่าการกระทรวงสาธารณสุข เป็นผู้แทนนายกรัฐมนตรี จอมพล ป. พิบูลสงคราม เป็นประธานในพิธี

กระทั่งพ.ศ. 2489 ได้กราบบังคมทูลเชิญพระบาทสมเด็จพระปรเมนทรมหาอานันทมหิดล พระอัฐมรามาธิบดินทร เสด็จพระราชดำเนินมาพระราชทานปริญญาบัตรให้กับบัณฑิตมหาวิทยาลัยแพทยศาสตร์ โดยพิธีพระราชทานปริญญาบัตรครั้งนั้นได้จัดขึ้นที่ปะรำหน้าตึกรังสี โรงพยาบาลศิริราช เป็นครั้งแรก เมื่อวันที่ 23 เมษายน พ.ศ. 2489 ซึ่งเป็นครั้งแรกและครั้งเดียวในรัชกาลนั้น

ต่อมาเมื่อ พ.ศ. 2493 พระบาทสมเด็จพระบรมชนกาธิเบศร มหาภูมิพลอดุลยเดชมหาราช บรมนาถบพิตร ได้เสด็จพระราชดำเนินมาพระราชทานปริญญาบัตรให้กับบัณฑิตมหาวิทยาลัยแพทยศาสตร์เป็นครั้งแรก จากนั้นก็ได้เสด็จพระราชดำเนินมาพระราชทานปริญญาบัตรด้วยพระองค์เรื่อยมา และเมื่อพระสุขภาพไม่อำนวยก็ทรงพระกรุณาโปรดเกล้าฯ ให้พระบรมวงศ์พระองค์อื่นเสด็จพระราชดำเนินแทนพระองค์มาโดยตลอด