หลังจากที่พระบาทสมเด็จพระบรมชนกาธิเบศร มหาภูมิพลอดุลยเดชมหาราช บรมนาถบพิตร พระราชทานพระนามาภิไธย “มหิดล” ให้เป็นนามใหม่ของมหาวิทยาลัยแพทยศาสตร์ เมื่อวันที่ 2 มีนาคม พ.ศ. 2512 แล้ว ในปีนั้น มหาวิทยาลัยมหิดลได้ออกระเบียบเรื่องเสื้อครุยวิทยฐานะสำหรับปริญญาบัณฑิต (ชั้นต่าง ๆ ) ในประเภทวิชาต่าง ๆ ของมหาวิทยาลัยมหิดล โดยใช้ลักษณะของเสื้อครุยวิทยฐานะเหมือนกับมหาวิทยาลัยแพทยศาสตร์ ทุกประการ
ต่อมาเมื่อได้รับพระราชทานพระวินิจฉัยเรื่องสีประจำมหาวิทยาลัยจากสมเด็จพระศรีนครินทราบรมราชชนนี และรับพระราชทานตราประจำมหาวิทยาลัยจากพระบาทสมเด็จพระบรมชนกาธิเบศร มหาภูมิพลอดุลยเดชมหาราช บรมนาถบพิตร แล้ว มหาวิทยาลัยได้ออกระเบียบใหม่ขึ้น โดยตราไว้ใน พระราชกฤษฎีกาว่าด้วยปริญญาในสาขาวิชา อักษรย่อสำหรับสาขาวิชา ครุยวิทยฐานะและเข็มวิทยฐานะของมหาวิทยาลัยมหิดล พ.ศ. 2513